Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GLI3P10071 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GLI3P10071 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GLI3P10071 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GLI3P10071 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GLI3P10071 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GLI3P10071 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GLI3P10071 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GLI3P10071 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GLI3P10071 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GLI3P10071 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GLI3P10071 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLI3P10071 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLI3P10071 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLI3P10071 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLI3P10071 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLI3P10071 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLI3P10071 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLI3P10071 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLI3P10071 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLI3P10071 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLI3P10071 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLI3P10071 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLI3P10071 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLI3P10071 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLI3P10071 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLI3P10071 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLI3P10071 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLI3P10071 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLI3P10071 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLI3P10071 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLI3P10071 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLI3P10071 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GLI3P10071 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLI3P10071 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLI3P10071 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLI3P10071 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLI3P10071 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GLI3P10071 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GLI3P10071 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GLI3P10071 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GLI3P10071 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GLI3P10071 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GLI3P10071 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GLI3P10071 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GLI3P10071 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GLI3P10071 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GLI3P10071 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GLI3P10071 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GLI3P10071 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GLI3P10071 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GLI3P10071 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GLI3P10071 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GLI3P10071 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GLI3P10071 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GLI3P10071 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GLI3P10071 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GLI3P10071 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GLI3P10071 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GLI3P10071 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GLI3P10071 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GLI3P10071 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GLI3P10071 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GLI3P10071 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GLI3P10071 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GLI3P10071 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GLI3P10071 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GLI3P10071 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GLI3P10071 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GLI3P10071 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GLI3P10071 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GLI3P10071 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GLI3P10071 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GLI3P10071 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GLI3P10071 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GLI3P10071 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GLI3P10071 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GLI3P10071 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GLI3P10071 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GLI3P10071 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GLI3P10071 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GLI3P10071 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GLI3P10071 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GLI3P10071 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GLI3P10071 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GLI3P10071 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GLI3P10071 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GLI3P10071 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GLI3P10071 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GLI3P10071 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GLI3P10071 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GLI3P10071 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GLI3P10071 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GLI3P10071 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GLI3P10071 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GLI3P10071 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GLI3P10071 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GLI3P10071 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GLI3P10071 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GLI3P10071 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms