Protein–RNA interactions for Protein: P0DMC3

APELA, Apelin receptor early endogenous ligand, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APELAP0DMC3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APELAP0DMC3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APELAP0DMC3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APELAP0DMC3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APELAP0DMC3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APELAP0DMC3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APELAP0DMC3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APELAP0DMC3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APELAP0DMC3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APELAP0DMC3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APELAP0DMC3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APELAP0DMC3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APELAP0DMC3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APELAP0DMC3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APELAP0DMC3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APELAP0DMC3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APELAP0DMC3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APELAP0DMC3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APELAP0DMC3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APELAP0DMC3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APELAP0DMC3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APELAP0DMC3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APELAP0DMC3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APELAP0DMC3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APELAP0DMC3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APELAP0DMC3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APELAP0DMC3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APELAP0DMC3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APELAP0DMC3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms