Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2CP0DJJ0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2CP0DJJ0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2CP0DJJ0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2CP0DJJ0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2CP0DJJ0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2CP0DJJ0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2CP0DJJ0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2CP0DJJ0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2CP0DJJ0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2CP0DJJ0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2CP0DJJ0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2CP0DJJ0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2CP0DJJ0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms