Protein–RNA interactions for Protein: P0CF51

TRGC1, T-cell receptor gamma chain C region 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRGC1P0CF51 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRGC1P0CF51 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRGC1P0CF51 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms