Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms