Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C4AP0C0L4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms