Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA1P09110 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms