Protein–RNA interactions for Protein: P02760

AMBP, Protein AMBP, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBPP02760 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBPP02760 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBPP02760 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBPP02760 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBPP02760 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBPP02760 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBPP02760 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBPP02760 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBPP02760 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBPP02760 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBPP02760 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBPP02760 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBPP02760 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBPP02760 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBPP02760 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBPP02760 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBPP02760 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBPP02760 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBPP02760 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBPP02760 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBPP02760 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBPP02760 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBPP02760 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBPP02760 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBPP02760 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBPP02760 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBPP02760 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBPP02760 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBPP02760 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBPP02760 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBPP02760 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBPP02760 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBPP02760 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBPP02760 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBPP02760 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBPP02760 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBPP02760 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBPP02760 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBPP02760 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBPP02760 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBPP02760 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBPP02760 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBPP02760 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBPP02760 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBPP02760 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBPP02760 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMBPP02760 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMBPP02760 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMBPP02760 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMBPP02760 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMBPP02760 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMBPP02760 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMBPP02760 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBPP02760 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBPP02760 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBPP02760 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBPP02760 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBPP02760 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBPP02760 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBPP02760 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBPP02760 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBPP02760 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBPP02760 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBPP02760 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBPP02760 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBPP02760 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBPP02760 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBPP02760 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBPP02760 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBPP02760 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBPP02760 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBPP02760 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBPP02760 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBPP02760 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBPP02760 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBPP02760 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBPP02760 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBPP02760 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBPP02760 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBPP02760 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBPP02760 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBPP02760 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBPP02760 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBPP02760 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBPP02760 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBPP02760 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBPP02760 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBPP02760 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBPP02760 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBPP02760 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBPP02760 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBPP02760 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBPP02760 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBPP02760 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBPP02760 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBPP02760 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBPP02760 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBPP02760 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBPP02760 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBPP02760 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms