Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD3O95983 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD3O95983 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD3O95983 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD3O95983 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD3O95983 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD3O95983 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD3O95983 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD3O95983 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD3O95983 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD3O95983 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD3O95983 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD3O95983 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD3O95983 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD3O95983 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD3O95983 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD3O95983 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD3O95983 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD3O95983 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MBD3O95983 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD3O95983 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD3O95983 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD3O95983 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD3O95983 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD3O95983 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD3O95983 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD3O95983 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD3O95983 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD3O95983 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD3O95983 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD3O95983 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD3O95983 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD3O95983 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD3O95983 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD3O95983 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD3O95983 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD3O95983 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MBD3O95983 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD3O95983 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD3O95983 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD3O95983 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD3O95983 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD3O95983 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD3O95983 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD3O95983 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD3O95983 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD3O95983 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD3O95983 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD3O95983 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD3O95983 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD3O95983 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD3O95983 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD3O95983 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD3O95983 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD3O95983 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD3O95983 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD3O95983 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD3O95983 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD3O95983 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD3O95983 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD3O95983 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD3O95983 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD3O95983 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD3O95983 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD3O95983 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD3O95983 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD3O95983 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD3O95983 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD3O95983 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD3O95983 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD3O95983 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD3O95983 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD3O95983 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD3O95983 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD3O95983 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD3O95983 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD3O95983 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD3O95983 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD3O95983 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD3O95983 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD3O95983 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD3O95983 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD3O95983 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD3O95983 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD3O95983 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD3O95983 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MBD3O95983 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD3O95983 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD3O95983 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD3O95983 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD3O95983 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD3O95983 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD3O95983 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD3O95983 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD3O95983 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD3O95983 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD3O95983 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD3O95983 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD3O95983 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD3O95983 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms