Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE4BO95155 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4BO95155 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms