Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNKO75909 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNKO75909 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNKO75909 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNKO75909 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNKO75909 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNKO75909 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNKO75909 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNKO75909 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNKO75909 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNKO75909 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNKO75909 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNKO75909 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNKO75909 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNKO75909 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNKO75909 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNKO75909 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNKO75909 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNKO75909 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNKO75909 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNKO75909 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNKO75909 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNKO75909 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNKO75909 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNKO75909 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCNKO75909 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCNKO75909 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCNKO75909 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCNKO75909 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNKO75909 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNKO75909 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNKO75909 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNKO75909 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNKO75909 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNKO75909 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNKO75909 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNKO75909 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNKO75909 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNKO75909 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNKO75909 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNKO75909 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNKO75909 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNKO75909 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNKO75909 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNKO75909 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNKO75909 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCNKO75909 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCNKO75909 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCNKO75909 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCNKO75909 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCNKO75909 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCNKO75909 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCNKO75909 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCNKO75909 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCNKO75909 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCNKO75909 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCNKO75909 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCNKO75909 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCNKO75909 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCNKO75909 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCNKO75909 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCNKO75909 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCNKO75909 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCNKO75909 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCNKO75909 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCNKO75909 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCNKO75909 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCNKO75909 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNKO75909 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNKO75909 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNKO75909 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNKO75909 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNKO75909 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNKO75909 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNKO75909 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNKO75909 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNKO75909 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNKO75909 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNKO75909 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNKO75909 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNKO75909 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNKO75909 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNKO75909 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNKO75909 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNKO75909 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNKO75909 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNKO75909 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNKO75909 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNKO75909 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNKO75909 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNKO75909 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNKO75909 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNKO75909 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNKO75909 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNKO75909 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNKO75909 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNKO75909 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNKO75909 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNKO75909 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNKO75909 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms