Protein–RNA interactions for Protein: O60888

CUTA, Protein CutA, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTAO60888 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUTAO60888 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CUTAO60888 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUTAO60888 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUTAO60888 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUTAO60888 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUTAO60888 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUTAO60888 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUTAO60888 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUTAO60888 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CUTAO60888 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUTAO60888 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUTAO60888 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUTAO60888 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUTAO60888 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUTAO60888 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUTAO60888 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUTAO60888 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUTAO60888 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CUTAO60888 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUTAO60888 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUTAO60888 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUTAO60888 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUTAO60888 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUTAO60888 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUTAO60888 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUTAO60888 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUTAO60888 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUTAO60888 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUTAO60888 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUTAO60888 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CUTAO60888 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUTAO60888 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUTAO60888 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUTAO60888 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUTAO60888 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUTAO60888 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CUTAO60888 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUTAO60888 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUTAO60888 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUTAO60888 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUTAO60888 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUTAO60888 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUTAO60888 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUTAO60888 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUTAO60888 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUTAO60888 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUTAO60888 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUTAO60888 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUTAO60888 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CUTAO60888 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUTAO60888 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CUTAO60888 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUTAO60888 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUTAO60888 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUTAO60888 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUTAO60888 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUTAO60888 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUTAO60888 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUTAO60888 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CUTAO60888 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUTAO60888 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUTAO60888 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CUTAO60888 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUTAO60888 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUTAO60888 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUTAO60888 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUTAO60888 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUTAO60888 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUTAO60888 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUTAO60888 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUTAO60888 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUTAO60888 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CUTAO60888 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUTAO60888 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUTAO60888 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUTAO60888 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUTAO60888 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUTAO60888 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUTAO60888 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUTAO60888 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CUTAO60888 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUTAO60888 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUTAO60888 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUTAO60888 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CUTAO60888 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUTAO60888 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUTAO60888 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUTAO60888 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUTAO60888 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUTAO60888 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUTAO60888 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUTAO60888 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUTAO60888 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUTAO60888 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUTAO60888 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUTAO60888 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUTAO60888 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUTAO60888 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUTAO60888 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms