Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNG3O60359 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG3O60359 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms