Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX6O43752 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX6O43752 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
STX6O43752 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX6O43752 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX6O43752 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX6O43752 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX6O43752 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX6O43752 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX6O43752 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
STX6O43752 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX6O43752 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX6O43752 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX6O43752 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX6O43752 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX6O43752 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX6O43752 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX6O43752 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX6O43752 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX6O43752 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX6O43752 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX6O43752 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX6O43752 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX6O43752 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX6O43752 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX6O43752 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX6O43752 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX6O43752 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX6O43752 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX6O43752 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX6O43752 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX6O43752 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX6O43752 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX6O43752 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX6O43752 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX6O43752 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX6O43752 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX6O43752 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX6O43752 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX6O43752 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX6O43752 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX6O43752 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX6O43752 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX6O43752 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STX6O43752 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STX6O43752 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STX6O43752 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STX6O43752 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STX6O43752 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STX6O43752 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX6O43752 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX6O43752 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX6O43752 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX6O43752 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX6O43752 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX6O43752 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
STX6O43752 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
STX6O43752 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX6O43752 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX6O43752 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX6O43752 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX6O43752 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX6O43752 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
STX6O43752 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX6O43752 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX6O43752 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX6O43752 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX6O43752 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX6O43752 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX6O43752 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX6O43752 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX6O43752 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX6O43752 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX6O43752 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX6O43752 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX6O43752 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX6O43752 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX6O43752 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX6O43752 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX6O43752 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX6O43752 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX6O43752 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX6O43752 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX6O43752 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX6O43752 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX6O43752 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX6O43752 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX6O43752 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX6O43752 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX6O43752 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX6O43752 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX6O43752 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX6O43752 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX6O43752 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX6O43752 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX6O43752 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX6O43752 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX6O43752 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
STX6O43752 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX6O43752 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms