Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATMINO43313 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATMINO43313 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATMINO43313 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATMINO43313 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATMINO43313 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATMINO43313 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATMINO43313 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATMINO43313 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATMINO43313 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATMINO43313 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATMINO43313 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATMINO43313 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATMINO43313 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATMINO43313 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATMINO43313 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATMINO43313 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATMINO43313 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATMINO43313 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATMINO43313 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATMINO43313 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATMINO43313 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATMINO43313 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATMINO43313 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATMINO43313 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATMINO43313 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATMINO43313 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATMINO43313 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATMINO43313 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATMINO43313 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATMINO43313 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATMINO43313 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATMINO43313 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATMINO43313 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATMINO43313 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATMINO43313 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATMINO43313 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATMINO43313 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATMINO43313 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATMINO43313 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATMINO43313 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATMINO43313 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMINO43313 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMINO43313 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMINO43313 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMINO43313 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMINO43313 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMINO43313 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMINO43313 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMINO43313 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMINO43313 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMINO43313 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMINO43313 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMINO43313 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMINO43313 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMINO43313 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMINO43313 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMINO43313 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMINO43313 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMINO43313 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMINO43313 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMINO43313 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMINO43313 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMINO43313 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMINO43313 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMINO43313 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMINO43313 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMINO43313 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMINO43313 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMINO43313 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMINO43313 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMINO43313 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMINO43313 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMINO43313 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMINO43313 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMINO43313 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMINO43313 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMINO43313 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMINO43313 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMINO43313 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMINO43313 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMINO43313 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATMINO43313 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATMINO43313 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATMINO43313 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATMINO43313 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATMINO43313 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATMINO43313 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATMINO43313 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATMINO43313 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATMINO43313 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATMINO43313 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATMINO43313 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATMINO43313 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATMINO43313 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATMINO43313 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATMINO43313 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATMINO43313 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATMINO43313 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATMINO43313 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms