Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXC11O43248 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms