Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVH48-1M5A8F1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVH48-1M5A8F1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms