Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP99D6REC4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP99D6REC4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms