Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CFAP73A6NFT4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.5 ms