Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6BA6NDN3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms