Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 DLEU1-231ENST00000490577 2440 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 UPP2-204ENST00000605860 2435 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 CCDC144CP-201ENST00000340196 2823 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 RCBTB2P1-201ENST00000453021 1462 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 NAGA-202ENST00000402937 1869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 TSPYL1-201ENST00000368608 3326 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 KCNMB1-202ENST00000521859 1733 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 GOSR2-219ENST00000638697 1705 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 LILRB2-201ENST00000314446 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 PPP6R2-201ENST00000216061 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 CACNA1F-201ENST00000323022 6037 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 MDH2-201ENST00000315758 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 CLPB-201ENST00000294053 3240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 RPS16-201ENST00000251453 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 KRTAP20-2-201ENST00000330798 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 AKR1E2-202ENST00000334019 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 FAM166A-201ENST00000344774 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 WT1-AS-201ENST00000395900 3828 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 SPATA3-203ENST00000424440 1011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 PDHX-202ENST00000430469 952 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 HUS1-202ENST00000432325 1125 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 SERBP1P4-201ENST00000446711 1162 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 AC122683.1-201ENST00000456335 717 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 RN7SL278P-201ENST00000488843 296 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 AC138035.2-201ENST00000509192 727 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 NREP-218ENST00000509427 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 AC098976.2-201ENST00000514144 881 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 SLC25A5P6-201ENST00000515328 886 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 IGHV7-56-201ENST00000518372 351 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 AP003062.1-201ENST00000528497 762 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 Z84723.1-201ENST00000568710 773 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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PTPRJQ12913 AL590096.1-202ENST00000618162 580 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 PSMB3-211ENST00000619426 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 AL121832.1-204ENST00000622414 548 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 SLC10A1-201ENST00000216540 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 SGK3-202ENST00000396596 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 LRRC18-201ENST00000374160 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 PJA1-204ENST00000374584 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 CTNNB1-203ENST00000396185 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 LARP4-206ENST00000518444 2853 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 MAP3K7CL-207ENST00000399934 1964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 SERPINA1-204ENST00000402629 1450 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 TSPEAR-204ENST00000614657 4027 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 HMGN3-AS1-201ENST00000604516 2946 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 POTED-201ENST00000299443 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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PTPRJQ12913 TKT-208ENST00000462138 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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PTPRJQ12913 NNT-202ENST00000344920 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 COL20A1-201ENST00000358894 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 APBB2-214ENST00000508593 3592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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PTPRJQ12913 LINC01270-202ENST00000457853 943 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 SLC25A38P1-201ENST00000458247 943 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 AC073517.1-201ENST00000468165 541 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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PTPRJQ12913 AC084033.3-203ENST00000546580 571 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 TCF4-AS1-201ENST00000587660 396 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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PTPRJQ12913 LYPD4-202ENST00000601246 1076 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 AL121658.1-201ENST00000608489 712 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 FDPS-220ENST00000611010 1196 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 ZNF646P1-201ENST00000621811 995 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 ERP29-201ENST00000261735 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 DYDC2-203ENST00000372198 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 NLRP2-209ENST00000537859 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 SPP1-203ENST00000395080 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 NICN1-208ENST00000615713 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 RAPGEF3-219ENST00000549151 3265 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 GYG1-210ENST00000484197 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 NCAPG2-201ENST00000356309 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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