Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAMTA1Q9Y6Y1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAMTA1Q9Y6Y1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms