Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y696

CLIC4, Chloride intracellular channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC4Q9Y696 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC4Q9Y696 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms