Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.52■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.52■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
USP16Q9Y5T5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP16Q9Y5T5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms