Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM35Q9UPQ4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms