Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNPO2Q9UMS6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms