Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CHIC2Q9UKJ5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms