Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CROTQ9UKG9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms