Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXNA1Q9UIW2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms