Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHY1

NRBP1, Nuclear receptor-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRBP1Q9UHY1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRBP1Q9UHY1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRBP1Q9UHY1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms