Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPARGC1AQ9UBK2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 275.6 ms