Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CHPF2Q9P2E5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms