Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTN3Q9P232 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms