Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI6

TFCP2L1, Transcription factor CP2-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2L1Q9NZI6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TFCP2L1Q9NZI6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TFCP2L1Q9NZI6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms