Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK13-1Q9NX77 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms