Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC37.29■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PDS5BQ9NTI5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PDS5BQ9NTI5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms