Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ATG3Q9NT62 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATG3Q9NT62 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms