Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SEMA3GQ9NS98 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SEMA3GQ9NS98 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SEMA3GQ9NS98 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SEMA3GQ9NS98 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3GQ9NS98 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3GQ9NS98 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3GQ9NS98 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms