Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms