Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SPHK2Q9NRA0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms