Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PRDM7Q9NQW5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRDM7Q9NQW5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PRDM7Q9NQW5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRDM7Q9NQW5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRDM7Q9NQW5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRDM7Q9NQW5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRDM7Q9NQW5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRDM7Q9NQW5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRDM7Q9NQW5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRDM7Q9NQW5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRDM7Q9NQW5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRDM7Q9NQW5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRDM7Q9NQW5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRDM7Q9NQW5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRDM7Q9NQW5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRDM7Q9NQW5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRDM7Q9NQW5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRDM7Q9NQW5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRDM7Q9NQW5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRDM7Q9NQW5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRDM7Q9NQW5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRDM7Q9NQW5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRDM7Q9NQW5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms