Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE7BQ9NP56 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE7BQ9NP56 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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