Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP08

HMX1, Homeobox protein HMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX1Q9NP08 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HMX1Q9NP08 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms