Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PRM3Q9NNZ6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRM3Q9NNZ6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRM3Q9NNZ6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRM3Q9NNZ6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRM3Q9NNZ6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRM3Q9NNZ6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PRM3Q9NNZ6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms