Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF3Q9H4W6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF3Q9H4W6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms