Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIPK3Q9H422 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms