Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA6BQ9H3T3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA6BQ9H3T3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms