Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDCL3Q9H2J4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCL3Q9H2J4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms