Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC68Q9H2F9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC68Q9H2F9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC68Q9H2F9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC68Q9H2F9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC68Q9H2F9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC68Q9H2F9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC68Q9H2F9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC68Q9H2F9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC68Q9H2F9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC68Q9H2F9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC68Q9H2F9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC68Q9H2F9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC68Q9H2F9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC68Q9H2F9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC68Q9H2F9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC68Q9H2F9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms