Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D6

XRN2, 5'-3' exoribonuclease 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRN2Q9H0D6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 28.4
XRN2Q9H0D6 IPO13-202ENST00000372343 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 28.4
XRN2Q9H0D6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.931e-9■■■■■ 28.3
XRN2Q9H0D6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.081e-9■■■■■ 28.3
XRN2Q9H0D6 RAPGEFL1-211ENST00000613811 1744 ntTSL 1 (best)33.76■■■□□ 2.993e-6■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 POLR2H-201ENST00000412877 836 ntTSL 225.93■■□□□ 1.742e-12■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.682e-12■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.682e-12■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 TNRC18-208ENST00000455076 577 ntTSL 224.13■■□□□ 1.453e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 NOP53-204ENST00000595143 810 ntTSL 523.87■■□□□ 1.414e-6■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 STMN3-203ENST00000631920 970 ntTSL 222.3■■□□□ 1.165e-6■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.75e-6■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 NOP53-205ENST00000597985 656 ntTSL 318.27■□□□□ 0.524e-6■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 DEAF1-207ENST00000527170 1623 ntTSL 1 (best)17.65■□□□□ 0.425e-6■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 RAPGEFL1-208ENST00000543876 560 ntTSL 417.64■□□□□ 0.413e-6■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.334e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.33e-6■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.214e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 RAPGEFL1-205ENST00000538884 540 ntTSL 416.03■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.144e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 DEAF1-204ENST00000525904 797 ntTSL 315.13■□□□□ 0.015e-6■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 DEAF1-212ENST00000530813 668 ntTSL 515.13■□□□□ 0.015e-6■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.274e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 NOP53-208ENST00000598959 501 ntTSL 512.9□□□□□ -0.344e-6■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 SOCS6-201ENST00000397942 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 RAPGEFL1-201ENST00000264644 3429 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.843e-6■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.672e-6■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 H2AFZ-203ENST00000511319 1254 ntTSL 1 (best)34.52■■■■□ 3.122e-8■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 H2AFZ-202ENST00000511203 1880 ntTSL 232.33■■■□□ 2.772e-8■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.822e-8■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 H2AFZ-205ENST00000527366 435 ntTSL 315.75■□□□□ 0.112e-8■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 H2AFZ-204ENST00000511348 1843 ntTSL 1 (best)14□□□□□ -0.172e-8■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 H2AFZ-206ENST00000529158 726 ntTSL 312.35□□□□□ -0.432e-8■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 ANKRD11-210ENST00000566858 580 ntTSL 419.42■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 IDI1-203ENST00000429642 1017 ntTSL 526.41■■□□□ 1.825e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 SEPT7-219ENST00000635476 506 ntTSL 525.53■■□□□ 1.681e-8■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 SEPT7-216ENST00000635172 509 ntTSL 225.53■■□□□ 1.681e-8■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 TRIM13-203ENST00000378183 1251 ntTSL 223.87■■□□□ 1.415e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 MAFF-205ENST00000441709 548 ntTSL 223.31■■□□□ 1.321e-8■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.281e-8■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 IDI1-205ENST00000491735 1066 ntTSL 1 (best)22.67■■□□□ 1.225e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.965e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.945e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 TRIM13-208ENST00000478111 478 ntTSL 220.38■□□□□ 0.855e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 GIGYF1-203ENST00000471340 478 ntTSL 520.25■□□□□ 0.835e-8■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 CTSD-205ENST00000438213 946 ntTSL 219.04■□□□□ 0.645e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 MAMDC4-203ENST00000479475 2603 ntTSL 1 (best)19.03■□□□□ 0.645e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.615e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.593e-9■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.525e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.485e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 CTSD-202ENST00000367196 907 ntTSL 517.93■□□□□ 0.465e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 MAFF-208ENST00000624676 3284 nt17.79■□□□□ 0.441e-8■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.425e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.413e-9■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 IDI1-204ENST00000482091 1029 ntTSL 517.46■□□□□ 0.395e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.345e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 CTSD-204ENST00000433655 2006 ntTSL 517.14■□□□□ 0.343e-9■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.311e-8■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.33e-9■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.293e-9■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.185e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.145e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 TRIM13-205ENST00000442421 692 ntTSL 515.89■□□□□ 0.135e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.113e-9■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 TRIM13-207ENST00000474805 403 ntTSL 515.55■□□□□ 0.085e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.065e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 CTSD-210ENST00000637381 374 ntTSL 515.37■□□□□ 0.055e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.043e-9■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.031e-8■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.111e-8■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 TPM4-212ENST00000590180 521 ntTSL 314.27□□□□□ -0.135e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.165e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.255e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 MAMDC4-205ENST00000485732 4112 ntTSL 1 (best)13.31□□□□□ -0.285e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.35e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 TPM4-209ENST00000588483 801 ntTSL 512.4□□□□□ -0.425e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 SLC7A5-203ENST00000565644 3983 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.65e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 SEPT7-208ENST00000475109 733 ntTSL 56.91□□□□□ -1.31e-8■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 SEPT7-211ENST00000493626 643 ntTSL 46.03□□□□□ -1.441e-8■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 SEPT7-217ENST00000635175 1464 ntTSL 25.9□□□□□ -1.461e-8■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 SEPT7-215ENST00000635047 760 ntTSL 45.77□□□□□ -1.491e-8■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 KDM3A-213ENST00000488971 975 ntTSL 34.16□□□□□ -1.745e-7■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 SEPT7-220ENST00000635669 569 ntTSL 44.07□□□□□ -1.761e-8■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 SEPT7-213ENST00000634600 583 ntTSL 23.28□□□□□ -1.881e-8■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 VAPA-205ENST00000578314 532 ntTSL 327.32■■□□□ 1.964e-11■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 MYC-204ENST00000520751 577 ntTSL 322.3■■□□□ 1.166e-14■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.864e-14■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.654e-14■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.624e-14■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.454e-14■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 MYC-203ENST00000517291 1023 ntTSL 1 (best)17.75■□□□□ 0.436e-14■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.054e-14■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 TPM4-208ENST00000588410 563 ntTSL 423.24■■□□□ 1.313e-6■■■■■ 28.2
XRN2Q9H0D6 SLC26A1-204ENST00000513138 265 ntTSL 313.11□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 28.2
Retrieved 100 of 21,068 protein–RNA pairs in 296.2 ms